植物大战僵尸2中的融合系统是该游戏区别于前作的核心玩法之一，允许玩家将两种不同植物结合生成全新战斗单位。融合后的植物通常兼具双亲特性且能力显著提升，例如向日葵与豌豆射手融合后可同时生产阳光和发动攻击。实现融合需满足特定条件，包括植物类型匹配、关卡进度解锁及资源充足等。并非所有植物都能自由组合，需参考游戏内融合手册的固定配方，错误搭配可能导致战斗力下降或功能冗余。
融合操作本身较为简单，通过拖拽一种植物到另一种植物上即可完成。但策略性体现在融合时机和位置选择上。建议在战斗中后期进行融合，因前期资源有限且基础植物已能应对普通僵尸。优先在僵尸密集区域或防线薄弱处部署融合植物，例如将寒冰射手与火炬树桩融合形成的寒冰烈焰豌豆，可同时对路径上的敌人造成减速和范围伤害。需注意部分融合植物会改变原有攻击模式，需重新适应其弹道和生效范围。
资源管理是融合玩法的关键制约因素。每次融合消耗的阳光值通常高于普通植物，需提前规划阳光产量。推荐在融合前种植双胞向日葵或使用阳光菇加速生产，避免因资源短缺导致防线崩溃。高阶玩家可通过瓷砖萝卜联动强化融合植物的持续作战能力，但该组合对操作节奏要求较高。融合植物无法二次融合，需谨慎选择最终形态，例如机枪射手与火炬树桩的终极组合能实现贯穿性火焰弹幕，但会永久占用两个卡槽位置。
不同世界关卡对融合策略有差异化需求。未来世界适合搭配高爆发融合植物应对机械僵尸，而黑暗时代则需侧重控制型融合来限制巫师僵尸的变形能力。部分特殊地形会限制融合效果，如海盗港湾的甲板区域需优先融合能够跨越障碍的投手类植物。实验证明，冰河世界中冰系融合植物的减速效果会被部分抵消，应改用纯输出型融合组合。
进阶技巧包括利用转基因系统定向获取稀有融合素材，以及通过植物进阶提升融合基础属性。融合植物的装扮效果往往能产生质变，例如增加溅射范围或附加特殊状态。部分融合组合存在隐藏加成，当特定植物相邻时会激活额外攻击特效。这些机制虽未在游戏中明确说明，但可通过实战测试逐步掌握。融合玩法极大丰富了战术维度，但需平衡创新与稳定性，避免因过度追求新奇组合而忽视防线整体强度。
