武器的选择直接影响战斗效率与团队协作效果。主炮推荐采用高爆发的轨道炮或具备穿透特性的粒子束武器，这类武器能有效对抗大型战舰的装甲，同时对护盾和舰体造成双重打击。副炮优先考虑射速快且弹道稳定的自动脉冲炮，适合拦截敌方战机与导弹。火炮系统的选择需平衡冷却时间与范围伤害，电磁投射器在清理密集敌群时表现突出。
武器配置需结合内源之力系统进行优化。战术内源之力能减少通量能量消耗，配合高能耗的等离子炮或光能武器时提升续航能力。指挥内源之力可缩短战术设备的冷却时间，适合搭配需要频繁激活的导弹阵列或EMP干扰器。运动内源之力则能增强舰载Archwing的机动性，弥补近防武器的射程局限。武器与内源之力的协同需根据团队分工调整，单人驾驶建议优先强化主炮与维修效率。
针对不同派系敌人需调整元素属性配置。Grineer战舰的合金装甲弱于腐蚀属性，主武器推荐搭载腐蚀投射器。Corpus舰队的护盾系统对磁力伤害敏感，副武器可装配磁暴发生器。Infested舰群惧怕火焰持续伤害，火焰喷射器或高温射线能有效压制其再生能力。元素组合需通过战斗航电设备实现，避免因过度堆叠单一属性而降低泛用性。
弹药管理与射程控制是持久战的关键。远距离交战优先使用具备弹道计算的制导导弹，配合舰载雷达提升命中率。中距离火力压制依赖脉冲武器的快速充能特性，注意保持与敌舰的夹角避免被集中火力。近距离遭遇时，等离子扩散炮的溅射伤害能同时破坏敌方舰载系统，但需谨慎控制过热风险。弹药转换器与通量能量扩容模块可解决弹匣容量不足的问题。舰员技能对武器效能的加成不可忽视。枪炮专精的舰员可提升火炮暴击率，维修专精成员则能加速武器冷却。在配置自动炮塔时，优先分配具备精准射击特性的舰员驻守。星舰改装应保留至少一个通用插槽，便于根据任务类型临时更换穿甲弹或干扰弹等特种弹药。武器系统的最终强度取决于舰体引擎的输出功率，过载运行可能导致火力中断。
