支线古墓是游戏的重要组成部分，每个古墓都有独特的解谜机制和挑战。这些古墓不仅提供额外的探索乐趣，还能获得丰厚的奖励。玩家需要通过观察环境、利用道具和解决物理谜题来完成挑战。
失落探险家古墓是早期遇到的支线古墓之一，目标是通过点燃支撑飞机的支柱使其坍塌，从而攀爬至宝藏处。进入洞穴后，左侧有三个灯笼，需将其投掷到裹有布条的木柱上。随后用弓箭射下悬挂尸体上的灯笼引燃木柱，并通过推倒木柱连锁点燃其他支柱。最后一个木柱需要从洞穴右侧高地射落火盆，利用摆动的火盆点燃货物，最终引燃支柱。飞机坍塌后，用剩余灯笼烧毁机身内货物即可攀爬获取宝藏。
登基大殿古墓的难点在于利用风力机制。该场景有两个开关，分别控制风口和木板高度。首先关闭风口，随后在调整木板高度时等待最下方风口开启。抓住时机跳上木板，待强风将劳拉吹至高处时迅速二段跳抓住屋檐。这一过程需要精确把握时机，风力会将劳拉送至更高平台，最终进入房间获取宝藏。
审判密室古墓要求玩家收集油桶并利用跷跷板原理到达高处。场景共有四个油桶，但三个即可满足需求。将油桶放置在跷跷板靠近入口的一侧，利用重量差使另一端翘起。快速跑上倾斜的跷跷板跳跃至对面岩壁，通过攀爬即可到达宝藏所在平台。注意其中一个油桶需要通过弓箭拉动重物撞击平台获得。
风暴卫士密室的环境较为黑暗，建议使用火箭点燃火盆照明。主要障碍是天然气管道，用火箭射击高台的天然气可清除障碍。随后通过突出的木条跳跃至对面平台即可找到宝藏。该古墓考验玩家在昏暗环境中的观察力和精准射击能力。
漫淹实验室需要解决带电水体的难题。首先开启电闸启动大门，随后破坏右侧障碍将木筏拉至对面。通过控制重物升降改变电灯位置，使水体暂时不带电。利用木筏作为支撑点，最终可安全通过带电区域并登上楼梯获取宝藏。整个过程需要合理安排操作顺序。
侍女的庙宇是后期才能进入的古墓，需要攀爬绳索技能。该场景有两个杆机关和一个水闸。开启水闸后，浮灯会顺水流推动第一个杆机关，借此跳至对岸。随后用弓箭操控第二个杆机关拦截河道，使浮灯继续推动机关完成通路。这个古墓考验玩家对机关连锁反应的理解和操作协调性。
