牢房系统的核心功能在于对敌方单位的捕获与囚禁，它是在玩家等级达到81级并击败特定NPC于禁通过点券商城购买图纸才能在主城内建造的重要建筑。成功建造牢房后，玩家在攻城胜利后便有概率捕获敌方的武将或NPC单位，将其关押为自己的俘虏。这一功能不仅能够直接削弱对手的可调配战力，被囚禁的敌方武将在其被释放或解救前将无法进行任何操作，从而在战略层面上为玩家创造优势。
囚禁功能直接服务于玩家的战略优势，通过成功挑战其他玩家并取得胜利，若其领主位于城内，同样有机会将其抓捕并关入牢房。这意味着牢房系统深度融入了游戏的PVP与国战玩法之中，成为了削弱敌对势力、彰显自身实力的一个重要手段。为了维持这一优势，玩家需要关注俘虏的状态，因为被关押的玩家武将有几率通过逃跑功能恢复正常，尽管该操作存在一定的冷却时间。及时管理牢房是巩固战果的必要环节。
除了战略层面的囚禁作用，牢房系统为玩家提供了稳定的资源产出途径。其主要方式是鞭挞俘虏，通过对俘虏施加刑罚，玩家可以从中获得角色经验值、锦囊以及兵书等奖励。所获经验的多少与俘虏的等级和官职高低直接相关，官职越高的俘虏鞭挞后提供的经验也更为丰厚。为了提升这一收益，游戏内设置了鞭笞等级，升级鞭笞等级需要消耗金币，等级越高，每次鞭挞获得的额外经验就越多。
牢房系统后来还追加了劳作功能，这进一步拓展了其资源产出价值。当玩家抓捕的俘虏达到一定数量时，便可以命令他们进行劳作，从而为主角产出额外的经验值。系统每日提供免费的劳作次数，当免费次数用尽后，玩家可以选择消耗金币来继续执行劳作选项，这为追求快速成长的玩家提供了一个可选的经验补充渠道。牢房的等级提升会解锁更强大的功能与更高的收益上限。牢房从1级开始建造，玩家角色等级提升至83级、85级、87级和89级，可以逐步解锁更高级别的牢房。
