共有三个隐藏成就，分别是南瓜先生大冒险小三角大英雄和宇宙的尘埃。这些成就的触发条件较为隐蔽，需要玩家在特定场景反复操作或等待特定事件完成。隐藏成就不会在游戏内直接提示，需通过特定行为解锁后才能在成就列表中查看。
南瓜先生大冒险和小三角大英雄均需在轮船二层与小女孩互动触发。当小女孩询问你知道这个娃娃是什么来历吗时，需反复切换场景（如出入船舱或上下楼梯），使她的玩偶随机变为南瓜先生或小三角。点击变化的玩偶即可解锁对应成就。部分玩家反馈需尝试多次才能成功，可能与场景切换频率或对话进度有关。
通关后火箭升空并播放制作人员名单时，需等待约3分50秒（BGM循环两遍至第三遍初期），火箭会降落在神秘地点并自动解锁成就。此成就暗示续作线索，且仅在实际触发后才会显示于成就列表。隐藏成就的设计与游戏开发团队前作南瓜先生大冒险小三角大英雄存在关联，部分场景还包含对时间旅行者的妻子存在与时间等文学作品的彩蛋引用。建议玩家在二周目集中探索隐藏内容，避免遗漏关键互动节点。
